Školarina osnovnih akademskih studija, po godini, za studente koji upisuju studijske programe Poslovna ekonomija i finansije i Saobraćajno inženjerstvo iznosi 1.600 eur-a u dinarskoj protivvrednosti. Za studijske programe Inženjerski menadžment u agrobiznisu i Ekologija/Ekološko inženjerstvo iznosi 1.350 eur-a u dinarskoj protivvrednosti. Studijski program Softversko inženjerstvo iznosi 1.500 eur-a u dinarskoj protivvrednosti, dok studijski program Poslovna ekonomija i finansije - studije na daljinu iznose takodje 1.500 eur-a u dinarskoj protivvrednosti.
Školarina za master akademske studije iznosi 2.000 eur-a u dinarskoj protivvrednosti za sve studijske programe. Omogućeno je plaćanje u više rata, pri čemu je minimalna uplata 500 eur-a u dinarskoj protivvrednosti.
Za studente koji su završili osnovne akademske studije na FIMEK-u omogućen je popust od 10%.
Školarina za celokupne doktorske studije u trajanju od tri godine za studijski program Poslovna ekonomija i studijski program Računarska tehnika i informatika iznosi 10.000€ u dinarskoj protivvrednosti, dok za studijski program Inženjerski menadžment u agrobiznisu školarina iznosi 8.000€ u dinarskoj protivvrednosti, uz mogućnost plaćanja u više za tri godine koliko traju doktorske studije.
